El cariotipo es el proceso de ordenar y emparejar todos los cromosomas que se encuentran en un organismo con el fin de obtener una visión completa de todos los cromosomas mapa de un individuo.
Pero primero asegurémonos de que entendemos qué son los cromosomas en primer lugar. Los cromosomas son estructuras que se ven similares a los hilos que están contenidos dentro del núcleo de cada una de las células de su cuerpo.
Cada estructura cromosómica contiene todo el plan de información genética de su cuerpo. Esto dicta la forma en que su cuerpo está estructurado, reacciona a los estímulos, predisposición a las enfermedades, etc. Las mujeres tienen 2 cromosomasX, y los hombres tienen un cromosomaX y un cromosomaY. Cada célula de su cuerpo contiene 23 pares de cromosomas, 46 cromosomas en total.
Para que los investigadores puedan entender las secuencias de cromosomas de cada paciente, utilizan el software de cariotipado . Este tipo de software está diseñado para realizar análisis cromosómicos, y evalúa la estructura y el número de cromosomas de una persona. Al hacer esto, los investigadores y científicos pueden detectar anormalidades.
En este artículo, exploraremos algunas de las mejores opciones de software que le permiten realizar análisis cariotipados.
Índice del contenido
Las 5 herramientas de cariotipado automatizado más utilizadas en 2019
1
ArgusSoft
ArgusSoft es una gran opción de software que le permite cariotipar automáticamente los cromosomas humanos por posición de la banda, y también se puede utilizar para cariotipar los cromosomas de animales y plantas en línea.
Características principales:
- Tinción de G, Q, R
- Cariotipado automatizado de cromosomas humanos con reconocimiento de curvaturas
- Cariotipado automatizado de los cromosomas del cerdo
- 3 bases incorporadas de ideogramas estándar de cromosomas humanos con varios niveles de claridad – niveles 400, 550 y 850
- Puede añadir bases de ideogramas de cromosomas estándar para otras especies animales y vegetales
- Métodos de preparación de muestras
- Entrada de imágenes de placas de metafase utilizando una cámara y un escáner
- Acompañar una imagen con gráficos
- División automatizada de cromosomas aplicados y en contacto
- Comparación de cromosomas e ideogramas
También puede utilizar ArgusSoft para entrenar el sistema de reconocimiento de cromosomas usando preparaciones preestablecidas, puede transferir imágenes de placas de metafase y cariogramas en una base de datos incorporada, puede producir patrones de informes, corregir cariogramas y también almacenar e imprimir imágenes y resultados de análisis.
Puede obtener formación y soporte para el uso de ArgusSoft en su página web oficial . El centro de soporte incluye servicios de formación, mantenimiento y consultoría.
2
HiBand por imagen espectral aplicada
HiBand es un software creado por Applied Spectral Imaging, que puede realizar análisis cromosómicos avanzados utilizando funciones de cariotipado digital. Este software
utiliza funciones de escaneo automatizado para un análisis en profundidad de la estructura cromosómica.
Puede utilizar la amplia gama de funciones de HiBand para indexar, contar, almacenar y gestionar los datos de los resultados. También puede utilizar este potente software para escanear la secuencia cromosómica automáticamente.
Los resultados obtenidos utilizando las características de cariotipado encontradas en HiBand pueden ser almacenados en una ubicación segura con capas protegidas con contraseña y encriptadas. Esto le permite tener la tranquilidad de perder cualquier dato importante de la secuenciación y, debido a esto, también mejora la eficiencia de su laboratorio.
La clasificación de los resultados se hace de una manera muy sencilla, sólo tiene que buscar la secuencia específica de los cromosomas, y todos los resultados se muestran en una pantalla bien contenida que ofrece fácil acceso para modificar, revisar y también añadir etiquetas a cualquiera de los archivos.
Características principales:
- Cariotipado de Brightfield en banda-G y banda R
- Cariotipado de fluorescencia: banda Q, banda R y FISH
- Cariotipado espectral
- Recuento cromosómico automático
- Indexación y clasificación de cromosomas
- Separación avanzada de cromosomas y mejora avanzada de la imagen
- Galería de imágenes – puede presentar todas las metafases de casos y cariotipos en una sola pantalla
- Puede comparar cromosomas – verlos uno al lado del otro
- Ideograma Abberant – puede agregar cromosomas, células, ideogramas y anotaciones en un generador de imágenes
HiBand utiliza flujos de trabajo totalmente automatizados para aumentar la eficiencia del laboratorio, tiene funciones de escaneo de «inicio y fin», encuentra metafases, lee automáticamente códigos de barras, carga imágenes en tiempo real durante el escaneo de diapositivas y también exporta al Portal y Base de Datos LIS del laboratorio.
3
Ikaros de MetaSystems
Este sistema de cariotipado tiene una interfaz de usuario muy intuitiva que ofrece todas las características en una sola pantalla. Esto permite un acceso fácil y rápido a toda la información obtenida.
Ikaros se puede utilizar con Neon, que es una plataforma diseñada para ayudar en la organización de datos de imágenes y casos. Neon recoge datos de todos los trabajos de imagenología, fuentes externas y le permite presentarlos de una manera fácil de entender usando un tablero de gestión de casos.
Esta herramienta le permite tener siempre información importante a mano y almacenada de forma segura, pero utiliza algoritmos de gestión de datos muy potentes, tiene una buena gama de formas de observar los datos y puede proporcionar búsquedas específicas basadas en palabras clave y características de los datos.
Echa un vistazo a más información sobre Neon y sus características aquí .
Ikaros soporta muchas técnicas diferentes de anillado – Brightfield G-Band y R-Band, Fluorescence Q-Band, R-Band y FISH – , ofrece un gran número de formas de cariogramas predefinidas para humanos, plantas y animales. Puede editar fácilmente estos formularios para añadir los datos necesarios para el tipo de investigación que está realizando.
El hecho de que puedas comparar cromosomas por clases o por cariogramas, te ofrece información muy útil que te permite identificar fácilmente las diferencias.
4
MetaClass de Microptic
MetaClass es un gran software de karyotyoping que está diseñado de forma modular. Este software le ayuda a realizar estudios de cariotipo y FISH de cromosomas.
MetaClass se compone de los siguientes módulos :
- Base de datos MetaClass
Base de datos que se puede instalar con cualquiera de los módulos de MetaClass. Le permite almacenar los detalles de los pacientes y le permite acceder fácilmente a los resultados. Puede crear informes personalizados en cualquier idioma con este módulo.
- MetaClass Cariotipado
Permite estudiar un cariotipo después de capturar digitalmente las imágenes de la fase de preparación de la metafase, y ordenarlas en pares en función de su tamaño, posición, etc. Este módulo le da resultados de excelente calidad cuando se trata de bandas cromosómicas, y también puede proporcionarle informes de aspecto profesional.
Las características clave incluyen:
- El estudio del cariotipo se analiza con un aumento de campo claro de 100X
- Puede capturar varias imágenes de la Metafase
- La calidad de imagen se puede modificar para obtener resultados más nítidos
- Clasificación automática de cromosomas
- 4 vistas de pantalla – Ventana de metafase, cariotipo y cromosomas no clasificados
- Puede mostrar prototipos de cromosomas
- Los cromosomas que no están clasificados pueden ser corregidos automática o manualmente – superposiciones, separación, cruces, rotaciones, etc.
- Los archivos de sesión de MTC o las imágenes BMP se pueden guardar y recargar en cualquier momento
- Puede exportar cromosomas individuales a la base de datos Metaclass con la posibilidad de añadir comentarios y notas
.
He aquí un ejemplo de un Metaclase informe de cariotipo .
- MetaClass FISH
Este es un módulo de análisis que permite obtener una imagen de Hibridación de Fluorescencia EN SITU (FISH). Este módulo captura imágenes usando sondas de ADN fluorescentes, y le permite confirmar anormalidades genéticas – trisomías, mocrodelecciones, reordenamientos cromosómicos, etc.
Las imágenes FISH se analizan con un aumento de 100X y, para una mayor claridad de imagen, también pueden capturar imágenes con diferentes filtros.
Si está interesado en obtener más información sobre los módulos presentados anteriormente, y otras características, puede echar un vistazo a través del catálogo MetaClass .
Si eres un tipo curioso y quieres ver un informe obtenido utilizando el método FISH, puedes hacer clic aquí para descargar un archivo PDF de muestra.
5
GenASis Bandview
GenASis Bandview es otro gran software de cariotipado que está construido a partir de módulos con diferentes capabitilitas. Puede utilizar esta aplicación para realizar diagnósticos de cariotipo y obtener resultados precisos.
Este software le permite personalizar completamente el flujo de trabajo y el proceso de diagnóstico, dependiendo de las necesidades de su empresa y de los objetivos que está tratando de alcanzar.
La amplia gama de herramientas proporcionadas en BandView son fácilmente accesibles con sólo un clic del ratón, y ofrece una potente experiencia de cariotipado G/R/C/Q-Band. Puede elegir entre un flujo de trabajo automatizado o manual cuando se trata de localizar metafases y capturar imágenes.
Las anormalidades cromosómicas, si se encuentran, se pueden observar a través de la adición, la eliminación o el reordenamiento del material genético del paciente. Con BandView, puede utilizar la banda de la técnica molecular de FISH.
FISH utiliza sondas fluorescentes para conectarse a diferentes partes del cromosoma, lo que permite que el software detecte y localice las anormalidades encontradas en secuencias específicas de ADN.
Conclusión
En este artículo, exploramos algunos de los mejores software de cariotipado automatizado que existen en el mercado a finales de 2018.
Las opciones de software de cariotipado cubiertas en este artículo le ofrecen una variedad de características que le ayudarán a alcanzar los objetivos de su empresa.
Usando este tipo de software, usted puede contar miles de estructuras cromosómicas rápidamente, analizar con diferentes técnicas profesionales y producir informes de alto grado que le permitirán identificar cualquier anormalidad con facilidad.
Nos encantaría saber cuál es su opinión sobre el software que presentamos en esta lista de los 5 primeros. Por favor, siéntase libre de hacérnoslo saber usando la sección de comentarios de abajo.
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